Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pan3Q640Q5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pan3Q640Q5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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