Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samhd1Q60710 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samhd1Q60710 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms