Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf215Q5SPX3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf215Q5SPX3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms