Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930567H17RikQ3V0K5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms