Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SvipQ3UZP4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SvipQ3UZP4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms