Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Znf48Q3US17 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Znf48Q3US17 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Znf48Q3US17 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Znf48Q3US17 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Znf48Q3US17 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Znf48Q3US17 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Znf48Q3US17 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Znf48Q3US17 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Znf48Q3US17 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Znf48Q3US17 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Znf48Q3US17 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Znf48Q3US17 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Znf48Q3US17 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Znf48Q3US17 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms