Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc102aQ3TMW1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc102aQ3TMW1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms