Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC1AQ14683 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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