Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 YIR020CYIR020C 303 nt0.22□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 RRP15YPR143W 753 nt0.22□□□□□ -2.37
TY1B-BRQ12193 MLP1YKR095W 5628 nt0.21□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 TMA20YER007C-A 546 nt0.21□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 YGL217CYGL217C 342 nt0.21□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt0.21□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 SDL1YIL167W 633 nt0.21□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 YJL049WYJL049W 1353 nt0.21□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 MXR1YER042W 555 nt0.2□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 VPS25YJR102C 609 nt0.2□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 PEX34YCL056C 435 nt0.2□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 GLG1YKR058W 1851 nt0.2□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 SPC2YML055W 537 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 YOR053WYOR053W 342 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 YDL196WYDL196W 330 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 RTR1YER139C 681 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 YLR311CYLR311C 348 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 RPL9BYNL067W 576 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 MUD2YKL074C 1584 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 SLS1YLR139C 1932 nt0.19□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 OSH6YKR003W 1347 nt0.18□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 YCR043CYCR043C 384 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 COG7YGL005C 840 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 YLR225CYLR225C 1224 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 MRPL50YNR022C 420 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 YLL020CYLL020C 306 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 GMC2YLR445W 567 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 YOL150CYOL150C 312 nt0.17□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.16□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 TAD1YGL243W 1203 nt0.16□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 IRC19YLL033W 693 nt0.16□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 GRX8YLR364W 330 nt0.16□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 IZH4YOL101C 939 nt0.16□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 YBR012CYBR012C 420 nt0.16□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt0.16□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 SPT21YMR179W 2277 nt0.16□□□□□ -2.38
TY1B-BRQ12193 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.15□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 KEG1YFR042W 603 nt0.15□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt0.15□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.15□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 RPC25YKL144C 639 nt0.15□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 YNR021WYNR021W 1215 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 YOR282WYOR282W 321 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 GPX2YBR244W 489 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 VAB2YEL005C 849 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 RPS24BYIL069C 408 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 CGI121YML036W 546 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 ABF2YMR072W 552 nt0.14□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 TOF2YKR010C 2316 nt0.13□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 DUO1YGL061C 744 nt0.13□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 YGR219WYGR219W 342 nt0.13□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt0.13□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 NUT2YPR168W 474 nt0.13□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 ARP9YMR033W 1404 nt0.13□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 YER046W-AYER046W-A 330 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 RCN1YKL159C 636 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 PGA1YNL158W 597 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 NDD1YOR372C 1665 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 AEP1YMR064W 1557 nt0.12□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 YDR509WYDR509W 348 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 BMT5YIL096C 1011 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 MPT5YGL178W 2580 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 SWF1YDR126W 1011 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 RSM27YGR215W 333 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 MFA2YNL145W 117 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 UTP10YJL109C 5310 nt0.11□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 SLD5YDR489W 885 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 ULI1YFR026C 510 nt0.1□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 NNF2YGR089W 2811 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 SEC5YDR166C 2916 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 YLR042CYLR042C 486 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 DLT1YMR126C 1029 nt0.09□□□□□ -2.39
TY1B-BRQ12193 POP8YBL018C 402 nt0.09□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 NUR1YDL089W 1455 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 YMR324CYMR324C 243 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 YOL024WYOL024W 519 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 HDA3YPR179C 1968 nt0.08□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 YLR031WYLR031W 561 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 YPL034WYPL034W 498 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 MUM2YBR057C 1101 nt0.07□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 YDR262WYDR262W 819 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 CYC7YEL039C 342 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 LOA1YPR139C 903 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 PIG1YLR273C 1947 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 YJR071WYJR071W 369 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 HYM1YKL189W 1200 nt0.06□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 YAL064WYAL064W 285 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 AI4Q0065 1671 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 YDL206WYDL206W 2289 nt0.05□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 SLI15YBR156C 2097 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 AFR1YDR085C 1863 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 MAM1YER106W 909 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 SUT2YPR009W 807 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 SLM6YBR266C 453 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 VIK1YPL253C 1944 nt0.04□□□□□ -2.4
TY1B-BRQ12193 PEP3YLR148W 2757 nt0.04□□□□□ -2.4
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