Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnn2Q08093 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnn2Q08093 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms