Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4BQ07343 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4BQ07343 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms