Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pax5Q02650 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pax5Q02650 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms