Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf7Q00417 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcf7Q00417 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms