Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx1P83917 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx1P83917 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms