Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx3P81067 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx3P81067 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx3P81067 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx3P81067 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx3P81067 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms