Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irx2P81066 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx2P81066 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Irx2P81066 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms