Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm3P62311 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm3P62311 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms