Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prox1P48437 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prox1P48437 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prox1P48437 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prox1P48437 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms