Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AL133330.1-201ENST00000510619 704 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 Z97198.1-201ENST00000452366 658 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 ZNF585A-205ENST00000588354 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AL354892.3-201ENST00000586101 1630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC131097.1-201ENST00000437438 739 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 TDGF1-205ENST00000542931 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD11P31277 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC131934.1-201ENST00000527799 912 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD11P31277 AC008592.5-201ENST00000607856 547 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms