Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo2P25801 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms