Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pou4f1P17208 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pou4f1P17208 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms