Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd4P10628 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms