Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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