Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TtrP07309 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TtrP07309 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TtrP07309 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtrP07309 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtrP07309 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtrP07309 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtrP07309 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TtrP07309 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtrP07309 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtrP07309 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtrP07309 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtrP07309 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtrP07309 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtrP07309 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtrP07309 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms