Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SparcP07214 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SparcP07214 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SparcP07214 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SparcP07214 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SparcP07214 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SparcP07214 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SparcP07214 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SparcP07214 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SparcP07214 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SparcP07214 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SparcP07214 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SparcP07214 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SparcP07214 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SparcP07214 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SparcP07214 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SparcP07214 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SparcP07214 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SparcP07214 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SparcP07214 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SparcP07214 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SparcP07214 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SparcP07214 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SparcP07214 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SparcP07214 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SparcP07214 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SparcP07214 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SparcP07214 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SparcP07214 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SparcP07214 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SparcP07214 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SparcP07214 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SparcP07214 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SparcP07214 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SparcP07214 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SparcP07214 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms