Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04224 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P04224 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04224 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04224 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04224 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04224 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04224 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04224 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P04224 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04224 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04224 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04224 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04224 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04224 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms