Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
AurkcO88445 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AurkcO88445 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms