Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cited2O35740 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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