Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Kcnk3O35111 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Kcnk3O35111 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Kcnk3O35111 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Kcnk3O35111 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Kcnk3O35111 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Kcnk3O35111 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk3O35111 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Kcnk3O35111 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Kcnk3O35111 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Kcnk3O35111 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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