Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf6O08584 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf6O08584 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Klf6O08584 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms