Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim55G3X8Y1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim55G3X8Y1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms