Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0P0

Gm8127, Predicted gene 8127, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8127E9Q0P0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8127E9Q0P0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms