Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms