Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
1700018G05RikA0A1B0GSI2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms