Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3550W4VSN7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm3550W4VSN7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3550W4VSN7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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