Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHA12Q9UN75 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHA12Q9UN75 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms