Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpc2Q9R244 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc2Q9R244 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms