Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prkab1Q9R078 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkab1Q9R078 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms