Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp11cQ9QZW0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms