Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Rdh11Q9QYF1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Rdh11Q9QYF1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Rdh11Q9QYF1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Rdh11Q9QYF1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Rdh11Q9QYF1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Rdh11Q9QYF1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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