Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW9

Slc7a8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a8Q9QXW9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc7a8Q9QXW9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc7a8Q9QXW9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms