Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
C9orf78Q9NZ63 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C9orf78Q9NZ63 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms