Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RAB6BQ9NRW1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms