Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms