Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms