Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trem3Q9JKE1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trem3Q9JKE1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms