Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim39Q9ESN2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim39Q9ESN2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms