Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chrnb2Q9ERK7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chrnb2Q9ERK7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238.6 ms