Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap1s2Q9DB50 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ap1s2Q9DB50 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms