Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arpc5lQ9D898 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arpc5lQ9D898 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arpc5lQ9D898 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arpc5lQ9D898 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arpc5lQ9D898 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arpc5lQ9D898 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arpc5lQ9D898 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arpc5lQ9D898 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arpc5lQ9D898 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arpc5lQ9D898 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arpc5lQ9D898 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arpc5lQ9D898 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms